始建于1866年的福州市第二医院，是福州市内建院最早的西医医院，是一所以骨科为龙头，集医、教、研、康复为一体的三级甲等医院，前身为英国皇家海军、英国领事馆合办的“海港医馆”；1887年易名为“塔亭医院”；1956年3月定名为“福州市第二医院”；2012年4月成为厦门大学非直属附属医院。医院开放床位1479张， 为福州市急救中心、福州市创伤医学中心、福州市神经医学中心、福州市骨伤康复中心的挂靠单位；获批国家卫健委骨科专项能力培训教学基地，为全省唯一获批单位；为全国首批国家骨科与运动康复临床医学研究中心核心成员单位；被认定为福建省创伤骨科急救与康复临床医学研究中心；医院拥有市级质量控制中心14个，省市挂靠学会26个；拥有2个国家级中西医结合重点专科；2个西医类省级重点专科，6个中医类省级重点专科；4个西医类市级重点专科，11个中医类重点专科； 医院骨科创建于1958年，拥有床位617张，14个病区，形成以创伤骨科、关节外科、脊柱外科、小儿骨科、骨与软组织肿瘤科、运动医学科、手足显微外科、足踝外科、骨内科9个亚专业为重点研究方向及1个骨科基础研究所全面发展的模式。
2023年6月19日，由福州市第二医院牵头，成立福州市第二总医院。
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