吴店镇，隶属于山东省菏泽市牡丹区，地处牡丹区西北部，东接黄堽镇牡丹街道，南与万福街道接壤，西与吕陵镇、高庄镇毗邻，北邻小留镇、高庄镇。 区域面积57.3平方千米。2018年，户籍人口60211人。
1979年1月，成立吴店公社。1983年12月，撤社建乡时，设立吴店乡。1995年10月，撤乡设立吴店镇。 2020年6月，吴店镇下辖1个社区、37个行政村。
2018年，吴店镇有工业企业56家，其中规模以上工业企业6家，营业面积超过50平方米以上的综合商店或超市170家。
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