西安交通大学医学部基础医学院（School of Basic Medicine, Xi 'an Jiaotong University Health Science Center）是西安交通大学医学部下设的二级学院。
学院的学科形成于1937年；1979年获得国务院学位委员会首批硕士学位授予权；1981年获国务院学位委员会首批博士学位授予权；1986年成立西安医科大学基础医学院；2000年4月西安医科大学与西安交通大学、陕西财经学院三校合并成立西安交通大学医学院，基础医学院取消建制；2014年底基础医学院恢复建制。
据2023年5月学院官网数据，学院下设10个教学系，开设1个本科专业；有博士后科研流动站3个，一级学科博士学位授权点2个，二级学科博士学位授权点1个，一级学科硕士学位授权点2个，二级学科硕士学位授权点1个；有教职员工247人，其中教授41人，副教授81人，博士生导师48人，硕士生导师117人，讲师61人。
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