重庆市司法局为重庆市人民政府组成部门。2018年10月机构改革，原重庆市司法局与重庆市政府法制办职责整合，重新组建重庆市司法局。 市委依法治市办设在重庆市司法局（下设秘书处、综合处）。
重庆市司法局内设有办公室、法治调研处、法治督察处、立法一处、立法二处、立法三处、立法四处、规范性文件管理处、社区矫正管理局等机构。
重庆市司法局管理市监狱局 、市教育矫治局（市戒毒管理局） ，所属事业单位4个：重庆仲裁办、重庆市公证处、重庆市法律援助中心（参公）、重庆市司法鉴定中心。
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