新疆医科大学第五附属医院始建于1937年，最初为“镇江铁路医院”，1958年以“兰州医院”进疆后更名为乌鲁木齐铁路中心医院。 2004年6月，随着铁路主辅分离改革，由乌鲁木齐市铁路中心医院整建制移交新疆医科大学，成为新疆医科大学第五附属医院暨第五临床医学院， 是一所集医疗、教学、科研、预防、康复为一体的综合性三级甲等医院。 现有在职职工1416人，其中，博硕士386人，高级职称194人，享受国务院特殊津贴4人，高层次人才79人，硕士生导师68人，博士生导师10人。
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