新疆农业科学院（Xinjiang Academy of Agricultural Sciences）是新疆维吾尔自治区人民政府直属的综合性农业科研机构。
新疆农业科学院创立于1955年，1964年在农林牧科研所基础上正式成立新疆农业科学院。
截至2023年9月，新疆农业科学院拥有在职职工931人，其中高级职称524人（正高级236人，副高级288人），高级职称占56.3%；有博士149人，硕士413人；据2024年1月科学院官网数据，新疆农业科学院拥有17个研究所（中心）、10个试验场站。建有国家、部委科技平台50个、自治区科技平台26个，中长期科研基地37个。
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