根据《国务院关于地方改革完善食品药品监督管理体制的指导意见》（国发〔2013〕18号），2013年7月29日，四川省人民政府办公厅正式印发《四川省食品药品监督管理局主要职责内设机构和人员编制规定的通知》（川办发48号），明确设立省食品药品监管局，2013年8月25日，新组建的四川省食品药品监督管理局正式挂牌运行。
截至2014年8月，四川在全省21个市（州）、183个县（市、区）均成立了食品药品监管局，全系统共核定各类人员编制17010名；新设立乡镇（街道）监管所1792个、乡镇食品安全办3801个，46401个农村村社和城镇社区聘请了49754名协管员 。
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