中华人民共和国江苏海事局根据《中央机构编制委员会办公室关于印发<交通运输部直属海事系统人员编制和机构设置方案的通知>》（中央编办发﹝2010﹞52号）和《交通运输部关于中华人民共和国江苏海事局主要职责机构设置和人员编制规定的通知》（交人劳发﹝2013﹞248号）而设立，为交通运输部直属正厅级行政机构，于2000年7月26日正式成立。
中华人民共和国江苏海事局下设常州海事局、南京海事局、镇江海事局、扬州海事局、江阴海事局、张家港海事局、南通海事局、泰州海事局、太仓海事局、常熟海事局等十个分支局。
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